O Programa de Pós-graduação oferece um Mestrado Interdisciplinar na área de concentração em Ambiente e Sistemas de Produção Agrícola, integrando diversas áreas do conhecimento para analisar as características socioambientais de Mato Grosso, estado que além de conter três biomas (Pantanal, Cerrado e Amazônia), está em transformação econômica, ambiental e social.  O programa visa formar profissionais qualificados para auxiliar no desenvolvimento de sistemas agrícolas sustentáveis, propor indicadores socioambientais e elaborar modelos para tomada de decisão, buscando conciliar o desenvolvimento agrícola com a conservação ambiental.
O público-alvo do programa abrange profissionais com diversas formações, desde da área de Ciêncas Agrárias, Engenharias,  até as Ciências Sociais. Ao concluir o curso, os egressos adquirirão uma visão sistêmica, conhecimento interdisciplinar, capacidade de pesquisa e habilidade de comunicação, tornando-se aptos a enfrentar os desafios da agricultura moderna e contribuir para um setor agropecuário/ambiental mais sustentável, justo e eficiente.

As ações do PPGASP estão em sua maioria alinhadas com o planejamento estratégico do programa, que consiste na seguinte Missão, Visão e Valores:

Missão: Formação de recursos humanos qualificados para o desenvolvimento de sistemas agrícolas em consonância com a conservação ambiental nos biomas e bacias hidrográficas brasileiras presentes no estado de Mato Grosso.
Visão: Ser um programa de referência nacional no desenvolvimento de pesquisas interdisciplinares em sistemas agrícolas e ambientais sustentáveis que integram os biomas e bacias hidrográficas mato-grossense.
Valores: Interdisciplinaridade; Valorização da Ciência; Compromisso ético e social; Sustentabilidade e Inovação; Conservação ambiental